Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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