Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOPXQ9BPY8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms