Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3GL2Q99962 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms