Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALPK3Q96L96 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms