Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SMIM12Q96EX1 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms