Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC58Q96CX6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms