Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms