Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC1Q96C34 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms