Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms