Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms