Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF12Q8WXF0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms