Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AGR3Q8TD06 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms