Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMYD1Q8NB12 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms