Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LNX2Q8N448 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms