Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BEST3Q8N1M1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BEST3Q8N1M1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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