Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APLFQ8IW19 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APLFQ8IW19 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms