Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2Q1Q7Z7E8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms