Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WDR53Q7Z5U6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms