Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZFYVE16Q7Z3T8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms