Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms