Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP43Q70EL4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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