Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VSTM1Q6UX27 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms