Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms