Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6P435 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6P435 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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