Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HES3Q5TGS1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms