Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms