Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HSD17B12Q53GQ0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms