Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RFTN2Q52LD8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms