Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF212Q495C1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF212Q495C1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms