Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms