Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGN9

GAB4, GRB2-associated-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB4Q2WGN9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GAB4Q2WGN9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms