Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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CDO1Q16878 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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