Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms