Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2F4Q16254 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F4Q16254 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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