Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms