Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GBX1Q14549 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GBX1Q14549 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GBX1Q14549 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GBX1Q14549 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GBX1Q14549 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBX1Q14549 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GBX1Q14549 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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