Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SPIDRQ14159 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPIDRQ14159 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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