Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TUBA3CQ13748 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms