Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAPSNQ13702 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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