Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEUROD1Q13562 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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