Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms