Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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TCIRG1Q13488 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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