Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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