Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CLN3Q13286 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CLN3Q13286 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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CLN3Q13286 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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CLN3Q13286 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CLN3Q13286 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CLN3Q13286 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLN3Q13286 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLN3Q13286 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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