Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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CHAF1BQ13112 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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