Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB40BQ12829 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms