Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP160Q12769 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms