Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RIPPLY1Q0D2K3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms