Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EP300Q09472 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EP300Q09472 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms