Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD47Q08722 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD47Q08722 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CD47Q08722 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms